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1、学习生物信息学有哪些比较好的网站或论坛
GreenGenes:也是16S库,不过它只收集比较全的序列。它提供了一个16S的标准化比对,并基于这个东西搞了个物种分类工具。EMBOSS:一个工具包,提供了几百个进行序列操作的工具。BioPerl、BioPython:Perl和Python的生物学模块。
参加线上或线下的培训课程。例如,中国大学MOOC(慕课)提供了一门名为“生物信息学概论”的课程,该课程由华中科技大学制作,共分为10章,涵盖了生物信息学的基础知识和实践技能。 自学相关书籍和教材。
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①:DrugBank数据库,它是加拿大阿尔伯塔大学(University of Alberta)研究人员将详细的药物数据和全面的药物目标信息结合起来,建立的真实可靠的生物信息学和化学信息学数据库。
2、介绍几个好的分子动力学模拟论坛
分子模拟论坛成立于2007年8月,论坛主要讨论分子动力学,量子化学,蒙特卡罗等模拟方法以及高性能并行计算技术在材料科学,药物设计和生物医学等领域的发展与应用。
Lammps,gromacs,amber都可以啊,不过安装就比较费事,要有教程啥的,如果不想麻烦你可以先去北鲲云超算平台了解一下这些软件,他们平台都是安装好的。
自己做了一个膜蛋白的同源模建(同源性不算很高),又做了动力学模拟,蛋白的体系还是比较大的,加起来能有1000多个氨基酸。
VESTA。VESTA也是Windows端比较好用的分子建模软件,这个软件是适用结构模型体积数据,比如说电子核密度和晶体形态的三维可视化的程序,并且还可以在同一个窗口中处理多个机构模型,体积数据以及晶体形态。
3、成都分迪科技有限公司怎么样?
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4、分子模拟论坛的介绍
集聚各方向的专家,热心讨论,共同进步。一个团结热心的管理团队,竭诚维护论坛的良好运行。
分子模拟,是指利用理论方法与计算技术,模拟或仿真分子运动的微观行为,广泛的应用于计算化学,计算生物学,材料科学领域,小至单个化学分子,大至复杂生物体系或材料体系都可以是它用来研究的对象。
分子模拟(Molecular Simulation) 利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为,进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。
模仿,仿效。 《晋书·文苑传·袁宏》 :“ 公琰 殖根,不忘 中正 。岂曰模拟,实在雅性。” 唐 柳宗元 《上裴行立中丞撰訾家洲亭记启》 :“累奉游宴,窃观物象。涉旬模拟,不得万一。
目前分子模拟在很多领域得到了广泛地应用。这主要得益于分子模拟理论的逐渐成熟和模拟工具的开发及完善。
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